Funkcjonowanie unii celnej wymaga od państw członkowskich stosowania jednolitych regulacji prawa celnego dla całego obszaru gospodarczego objętego wspólnymi zasadami obrotu towarowego z zagranicą. Stawia to istotne wyzwania dla wszystkich administracji celnych realizujących politykę celną w ramach unii celnej. Działania państw członkowskich powinny w tym zakresie umożliwiać prawidłowy rozwój gospodarczy oraz wysoki poziom ochrony interesów społecznych i gospodarczych ugrupowania integracyjnego. Zależności te powodują konieczność koordynacji działań administracji regulujących obrót towarowy z zagranicą w poszczególnych państwach członkowskich unii celnej. W Unii Europejskiej konieczność koordynacji działań w ramach funkcjonowania całego systemu celnego stała się podstawą gruntownej reformy regulacji prawnych określających ustrojowy, materialnoprawny i proceduralny model funkcjonowania unii celnej. Wdrażane zmiany legislacyjne mają na celu reformę informatyczną zapewniającą integrację rozwiązań informatycznych służących administrowaniu obrotem towarowym z zagranicą oraz powołanie nowych podmiotów administrujących mających zapewnić właściwą koordynację działań w ramach systemu celnego Unii Europejskiej.
